A fő célja amikrotom pengea beágyazott biológiai vagy ipari minták egységes, ultravékony (általában 0,5-60 mikrométer vastag) metszeteinek levágása. Ezeket a metszeteket ezután tárgylemezekre helyezzük, megfestjük, és mikroszkóp alatt megvizsgáljuk.
Főbb alkalmazások:
- Szövettan (orvosi/biológiai kutatás): Emberi vagy állati szövetek metszete (pl. máj, bőr, daganatok) olyan betegségek diagnosztizálására, mint a rák.
- Patológia: Sebészeti biopsziás minták előkészítése gyors elemzéshez műtét közben vagy után.
- Botanika: Növényi szárak, levelek vagy gyökerek szeletelése a sejtszerkezet tanulmányozása érdekében.
- Idegtudomány: Az agyszövet vékony szakaszainak létrehozása az idegi kapcsolatok feltérképezésére.
- Anyagtudomány: polimerek, műanyagok, textíliák vagy akár kemény anyagok, például csontok vagy fogak vágása a minőségellenőrzés érdekében.

